当社グループの前身は、現代表取締役社長西郷辰弘が医薬品等の小売業を目的として、1978年4月に岩手県紫波郡都南村永井(現 盛岡市永井)において、現代表取締役副社長西郷喜代子とスーパーマーケット都南プラザにテナントとして入店し、都南プラザドラッグを個人で創業したことに始まります。その後、1981年2月に有限会社薬王堂(出資金5百万円)を岩手県紫波郡矢巾町大字白沢第5地割116番地に設立いたしました。1983年より単独出店し、店舗の大型化に取り組み、1991年6月にチェーンストア企業を本格的に志向するため、有限会社薬王堂を組織変更し、「株式会社薬王堂」を岩手県盛岡市中野一丁目16番5号に設立いたしました。
株式会社薬王堂設立後の当社グループの変遷は次のとおりであります。

年 月	概 要
1991年6月	有限会社薬王堂を組織変更し、株式会社薬王堂(資本金10百万円)として設立。
1992年8月	岩手県盛岡市に県内初の150坪型ドラッグストア「津志田店」を開店。(2010年9月閉店、2012年8月300坪型移転オープン)
1995年3月	岩手県花巻市に県内初の300坪型ドラッグストア「花巻南店」を開店。
1996年3月	発注業務の合理化を図るためEOS「オンライン発注システム」を導入。
1996年12月	岩手県紫波郡に県内初の450坪型スーパードラッグストア「矢巾店」を開店。
	本社を岩手県紫波郡矢巾町大字南矢幅第7地割82番地1(現 445番地)に移転。
1999年3月	有限会社薬王堂販売(100%子会社、資本金3百万円)を岩手県盛岡市中野一丁目16番5号に設立。
1999年8月	販売業務の合理化を図るためPOS(販売時点情報管理システム)レジを全店に導入。
2000年3月	物流システム効率化のため、岩手県紫波郡に薬王堂物流センター(岩手センター)を開設。(2005年9月移転)
2000年5月	宮城県栗原市に宮城県進出第1号店としてイオンタウンショッピングセンター内に「金成店」を開店。(2013年7月移転)
2000年7月	秋田県横手市に秋田県進出第1号店として300坪型ドラッグストア「横手店」を開店。
2000年10月	調剤併設型店舗第1号店として岩手県紫波郡の「矢巾店」内に調剤薬局を増設開店。
2002年8月	青森県八戸市に青森県進出第1号店として300坪型ドラッグストア「八戸新井田店」を開店。
2005年9月	岩手県紫波郡に200店舗まで対応可能な大型物流センターを開設。(2015年10月閉鎖)
	株式会社ジャスダック証券取引所に株式を上場。
2005年10月	岩手県盛岡市に日配物流センターを開設。(2013年4月閉鎖)
2007年9月	本社を岩手県紫波郡矢巾町大字広宮沢第3地割242番地1(現 426番地)に移転。
2007年10月	岩手県盛岡市に600坪型スーパードラッグストア「盛岡厨川店」を開店。
2008年7月	山形県山形市に山形県進出第1号店として300坪型ドラッグストア「山形馬見ヶ崎店」を開店。(2014年10月閉店)
2011年6月	岩手県紫波郡に調剤専門薬局「西徳田調剤」を開設。
2012年6月	有限会社薬王堂販売を吸収合併。
2013年4月	岩手県花巻市、宮城県岩沼市他3拠点で低温物流センターを開設。
2013年11月	東京証券取引所JASDAQ(スタンダード)から市場第二部へ市場変更。
2014年10月	東京証券取引所市場第一部銘柄に指定。
2015年10月	岩手県花巻市、宮城県白石市にDC型物流センター、岩手県紫波郡に食品ドライセンターを開設。
2016年7月	宮城県岩沼市に食品ドライセンターを開設。
2017年1月	プリペイド機能付きポイントカード「WA!CA(ワイカ)」を導入。
2017年10月	セルスペクト株式会社とヘルステック・ビッグデータ利活用事業に関する協業契約を締結。
2018年4月	マーケティング事業等の子会社としてMedica株式会社を設立。