当社は、大正11年6月5日武田長兵衞商店(現 武田薬品工業株式会社)の化学薬品部を分離し、大阪府西成郡神津村字堀72番地(現 大阪市淀川区十三本町)に資本金10万円をもって武田化学薬品株式会社として、設立されました。
設立以降の主要事項は次のとおりであります。

年月	事項
昭和10年2月	東京支店を東京市日本橋区に開設
昭和15年2月	大阪工場を兵庫県尼崎市に新設
昭和19年1月	東京工場を東京都板橋区に新設
昭和19年7月	本社を大阪工場所在地に移転
昭和22年10月	商号を和光純薬工業株式会社に変更
昭和27年2月	本社を大阪市東区(現中央区)に移転
昭和38年3月	大阪市東区(現中央区)に和光純薬ビルディング株式会社(連結子会社 後に株式会社BSワコーに社名変更)を設立
昭和38年6月	東京支店を東京都中央区に移転
昭和39年6月	兵庫県尼崎市にワコー理科工業株式会社(連結子会社 後に株式会社ワコーケミカルと合併)を設立
昭和39年12月	東京工場を埼玉県川越市に移転
昭和42年5月	東京研究所(現試薬・化成品研究所)を完成(東京工場所在地に同じ)
昭和42年6月	大阪研究所(現臨床検査薬研究所)を完成(大阪工場所在地に同じ)
昭和43年8月	播磨分工場(現播磨工場)を兵庫県赤穂市に新設
昭和49年6月	西ドイツ(現ドイツ)現地法人としてドイツ和光純薬有限会社(現・連結子会社)を設立
昭和56年3月	米国現地法人として米国和光純薬株式会社(連結子会社 後に持株会社化され米国和光ホールディングス株式会社に社名変更)を設立
昭和57年3月	株式会社竹腰化学(連結子会社 後に株式会社ワコーケミカルと合併)の株式を取得
昭和61年10月	埼玉県児玉郡上里町に株式会社ワコーケミカル(現・連結子会社)を設立
昭和63年12月	三重工場を三重県三重郡菰野町に新設
平成元年7月	大阪市中央区に株式会社ワコー物流(連結子会社 後に和光純薬ビルディング株式会社と合併し株式会社BSワコーに社名変更)を設立
平成2年3月	宮崎工場を宮崎県宮崎郡清武町(現宮崎県宮崎市清武町)に新設
平成3年7月	東京標準血清株式会社と合併し、長野県松本市の同社松本工場を当社松本工場とする
平成15年4月	株式会社ワコーケミカルはワコー理科工業株式会社及び株式会社竹腰化学を合併し本社を大阪市住之江区に移転
平成15年4月	和光純薬ビルディング株式会社は株式会社ワコー物流を合併し株式会社BSワコー(現・連結子会社)に社名変更
平成16年5月	愛知工場を愛知県豊橋市新西浜町に新設
平成19年4月	宮崎工場を会社分割により株式会社ワコーケミカルに移管し、株式会社ワコーケミカルは本社を宮崎県宮崎郡清武町(現宮崎県宮崎市清武町)に移転
平成20年3月	松本工場における生産を終了
平成22年4月	大阪市中央区に株式会社湘南ラボサポート(現・連結子会社)を設立
平成24年4月	米国和光純薬株式会社の子会社として米国和光オートメーション株式会社(現・連結子会社)を設立
平成24年9月	中国現地法人として和光純耀(上海)化学有限公司(現・連結子会社)を設立
平成24年10月	米国和光純薬株式会社を持株会社化し、社名を米国和光ホールディングス株式会社(現・連結子会社)へ変更し、その子会社として米国和光純薬株式会社(現・連結子会社)及び米国和光ライフサイエンス株式会社(現・連結子会社)を設立
平成26年2月	東京支店を東京都中央区内で移転し、名称を東京本店に改称
平成27年12月	株式会社シバヤギを買収(現・連結子会社)
平成29年4月	当社株式に対する公開買付けの結果、親会社及び筆頭株主が富士フイルム株式会社へ異動