当社の前身は森永太一郎が1899年8月東京赤坂に創設した日本初の洋菓子専門工場「森永西洋菓子製造所」であります。会社設立以来の事業の変遷は次のとおりであります。

1910年2月	資本金30万円をもって「株式会社森永商店」設立
1912年11月	「森永製菓株式会社」と改称
1920年7月	日本煉乳㈱を合併(これにより三島工場を承継)
1921年3月	塚口工場新設
1923年3月	自社品販売会社森永製品販売㈱設立(以降全国各地に設立)
4月	丸ビルに森永キャンデーストア開店
1925年6月	鶴見工場新設
1942年10月	森永乳業㈱、森永食品工業㈱(これにより中京工場を承継)、東海製菓㈱(これにより小山工場を承継)、森永関西牛乳㈱を合併
1943年11月	「森永食糧工業株式会社」と改称
1947年5月	久留米工場を建設し醸造業を併営
1949年4月	森永乳業㈱設立
5月	東京・大阪・名古屋証券取引所に上場
8月	商事部門を分離し、森永商事㈱(旧)として発足
10月	乳業部門を分離し、森永乳業㈱に譲渡
10月	「森永製菓株式会社」に復称
1954年7月	売店部門を分離し、㈱森永キャンデーストア(1987年㈱レストラン森永に社名変更)として発足
1961年12月	台湾製菓股份有限公司と資本提携(現・台湾森永製菓股份有限公司、連結子会社)
1965年3月	大和食品㈱を設立(現・森永エンゼルデザート㈱、連結子会社)
8月	当社と米国ゼネラルミルズ社との合弁で森永ゼネラルミルズ㈱を設立(1980年森永スナック食品㈱に社名変更)
1969年10月	森永商事㈱(旧)を合併
1970年12月	森永開発㈱を設立
1973年9月	森和商事㈱を設立(現・森永商事㈱、連結子会社)
1980年1月	森永デザート㈱を設立(現・連結子会社)
1987年4月	小山新工場完成
1999年4月	森永開発㈱を合併
2001年7月	㈱レストラン森永より営業権を譲り受け、㈱エンゼルフードシステムズを設立
2003年3月	摩利哪呷(上海)食品有限公司を設立(現・上海森永食品有限公司、連結子会社)
2004年12月	㈱エンゼルフードシステムズの株式を譲渡
2008年1月	㈱アントステラ(現・連結子会社)を100%子会社に持つ㈱ディユーアソシエイツの株式を 全株取得(同年10月 ㈱アントステラが㈱ディユーアソシエイツを吸収合併)
8月	米国森永製菓㈱を設立(現・連結子会社)
2010年12月	森永食品(浙江)有限公司を設立(現・連結子会社)
2011年4月	高崎森永㈱を設立(現・連結子会社)
2013年6月	塚口工場閉鎖
10月	森永キノインドネシア㈱を設立
12月	森永アメリカフーズ㈱を設立(現・連結子会社)
2019年1月	森永キノインドネシア㈱の株式を譲渡
5月	森永アジアパシフィック㈱を設立(現・連結子会社)
2020年1月	森永スナック食品㈱を合併
2022年4月	東京証券取引所の市場区分の見直しにより市場第一部からプライム市場へ移行