| 年月 | 事項 |
| 2004年5月 | 東京都港区南青山に株式会社モルフォを設立 |
| 2004年9月 | 本社を東京大学本郷キャンパス内(東京都文京区本郷)に移転 |
| 2011年7月 | 東京証券取引所マザーズ市場に株式上場 |
| 2012年2月 | 米国子会社「Morpho US, Inc.」を設立 |
| 2013年10月 | 韓国子会社「Morpho Korea, Inc.」を設立 |
| 2014年4月 | 本社を東京都千代田区西神田に移転 |
| 2015年12月 | 株式会社デンソーと資本業務提携 |
| 2017年4月 | 株式会社エスアールエルと業務提携 |
| 2017年11月 | みらかホールディングス株式会社(現 H.U.グループホールディングス株式会社)と資本提携 |
| 2018年8月 | 中国子会社「Morpho China, Inc.」を設立 |
| 2018年10月 | フィンランドのAI開発企業「Top Data Science Ltd.」を子会社化 |
| 2019年11月 | PUX株式会社を持分法適用関連会社化 |
| 2019年12月 | 国内子会社「株式会社モルフォAIソリューションズ」を設立 |
| 2020年6月 | 台湾子会社「Morpho Taiwan, Inc.」を設立 |
| 2021年6月 | フィンランドのAI開発企業「Top Data Science Ltd.」を完全子会社化 |
| 2021年9月 | 株式会社ミックウェアと業務提携 |
| 2022年4月 | 本社を東京都千代田区神田錦町に移転 |
| 2022年4月 | 東京証券取引所の市場区分見直しにより、東京証券取引所市場マザーズ市場からグロース市場に移行 |
| 2024年9月 | ソニーセミコンダクタソリューションズ株式会社と資本業務提携 |
| 2025年3月 | 「Top Data Science Ltd.」の株式を対象会社及び対象会社従業員に一部譲渡し、持分法適用関連会社に変更 |
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