当社の創業は明治8年初代島津源蔵が京都市木屋町二条において、個人経営により教育用理化学器械製作の業を興したのにはじまり、その後明治30年蓄電池の製造を開始、明治42年わが国初の医療用X線装置を完成するなど順次業容を拡大し、大正6年には蓄電池部門を分離独立(後の日本電池株式会社、現株式会社ジーエス・ユアサ コーポレーション)させるとともに、同年9月をもって資本金200万円で株式会社に改組しました。現在、精密機器の総合メーカーとして、計測機器、医用機器、航空機器、産業機器など多彩な製品を各方面に供給しています。株式会社に改組後の主な経歴はつぎのとおりです。
なお、主な経歴中の子会社は、すべて連結子会社です。

大正 6年 9月	株式会社島津製作所設立(本店 京都市木屋町二条) 東京支店(現支社)、大阪支店(現関西支社)および福岡支店(現九州支店)設置
8年 8月	京都市中京区河原町二条に本店移転
8年10月	三条工場開設、産業機器の製造開始
昭和10年 6月	名古屋、札幌両営業所(現支店)開設
13年 4月	京都証券取引所に株式上場
19年 4月	紫野工場開設
28年 5月	広島営業所(現支店)開設
30年 7月	京都営業所(現支店)開設
31年10月	航空機器部門新設
34年 4月	仙台出張所(現東北支店)開設
37年 1月	当社材料工場銑鉄鋳物部門を分離し、島津金属工業株式会社(現島津メクテム株式会社)を設立
41年10月	神戸出張所(現支店)開設
42年12月	高松出張所(現四国支店)開設
43年 8月	西独(現ドイツ)にシマヅ オイローパ ゲーエムベーハー(SHIMADZU EUROPA GmbH)を設立
44年 4月	当社理化器械部を分離し、島津理化器械株式会社(現株式会社島津理化)を設立
47年 4月	株式会社京都科学研究所(現株式会社島津テクノリサーチ)を設立
50年 7月	米国にシマヅ サイエンティフィック インスツルメンツ インク(SHIMADZU SCIENTIFIC INSTRUMENTS,INC.)を設立
54年 4月	米国にシマヅ プレシジョン インスツルメンツ インク(SHIMADZU PRECISION INSTRUMENTS,INC.)を設立
54年 7月	筑波営業所(現つくば支店)開設
55年 5月	神奈川事務所(現横浜支店)開設
60年 1月	北関東営業所(現支店)開設
60年 9月	厚木工場開設
61年12月	京都市中京区西ノ京桑原町に本店移転
平成元年 5月	英国のクレイトス グループ ピーエルシー(KRATOS GROUP PLC)を買収
元年11月	シンガポールにシマヅ(エイシア パシフィック)プライベイト リミテッド[SHIMADZU(ASIA PACIFIC)PTE.LTD.]を設立
2年 4月	静岡営業所(現支店)開設
3年 7月	けいはんな研究所(現基盤技術研究所)開設
3年 9月	秦野工場開設
8年10月	米国にシマヅ ユーエスエー マニュファクチュアリング インク(SHIMADZU U.S.A. MANUFACTURING,INC.)を設立
9年 2月	島根島津株式会社を設立
9年10月	中国に島津(香港)有限公司を設立
15年 1月	田中耕一記念質量分析研究所を開設
23年 4月	分析計測機器のサービス関連子会社を株式会社島津アクセスとして統合・再編