当社の創業は1875年初代島津源蔵が京都市木屋町二条において、個人経営により教育用理化学器械製作の業を興したのにはじまり、その後1897年蓄電池の製造を開始、1909年わが国初の医療用X線装置を完成するなど順次業容を拡大し、1917年には蓄電池部門を分離独立(後の日本電池株式会社、現株式会社ジーエス・ユアサ コーポレーション)させるとともに、同年9月をもって資本金200万円で株式会社に改組しました。現在、精密機器の総合メーカーとして、計測機器、医用機器、航空機器、産業機器など多彩な製品を各方面に供給しています。株式会社に改組後の主な経歴はつぎのとおりです。
なお、主な経歴中の子会社は、すべて連結子会社です。

1917年 9月	株式会社島津製作所設立(本店 京都市木屋町二条) 東京支店(現支社)、大阪支店(現関西支社)および福岡支店(現九州支店)設置
1919年 8月	京都市中京区河原町二条に本店移転
1919年10月	三条工場開設、産業機器の製造開始
1935年 6月	名古屋、札幌両営業所(現支店)開設
1938年 4月	京都証券取引所に株式上場
1944年 4月	紫野工場開設
1953年 5月	広島営業所(現支店)開設
1955年 7月	京都営業所(現支店)開設
1956年10月	航空機器部門新設
1959年 4月	仙台出張所(現東北支店)開設
1961年 9月	高松事務所(現四国支店)開設
1962年 1月	当社材料工場銑鉄鋳物部門を分離し、島津金属工業株式会社(現島津産機システムズ株式会社)を設立 瀬田工場開設
1963年 7月	京都計装株式会社(現島津システムソリューションズ株式会社)を設立
1966年 2月	大阪丸十放射線サービス株式会社(現島津メディカルシステムズ株式会社)を設立
1966年10月	神戸出張所(現支店)開設
1968年 8月	西独(現ドイツ)にシマヅ オイローパ ゲーエムベーハー(SHIMADZU EUROPA GmbH)を設立
1969年 4月	当社理化器械部を分離し、島津理化器械株式会社(現株式会社島津理化)を設立
1972年 4月	株式会社京都科学研究所(現株式会社島津テクノリサーチ)を設立
1975年 7月	米国にシマヅ サイエンティフィック インスツルメンツ インク(SHIMADZU SCIENTIFIC INSTRUMENTS,INC.)を設立
1979年 4月	米国にシマヅ プレシジョン インスツルメンツ インク(SHIMADZU PRECISION INSTRUMENTS,INC.)を設立
1979年 7月	筑波営業所(現つくば支店)開設
1980年 5月	神奈川事務所(現横浜支店)開設
1985年 1月	北関東営業所(現支店)開設
1985年10月	厚木工場開設
1986年12月	京都市中京区西ノ京桑原町に本店移転
1989年 6月	英国のクレイトス グループ ピーエルシー(KRATOS GROUP PLC)を買収
1989年11月	シンガポールにシマヅ(エイシア パシフィック)プライベイト リミテッド[SHIMADZU(ASIA PACIFIC)PTE.LTD.]を設立
1990年 2月	メトロン株式会社(現島津サイエンス東日本株式会社、島津サイエンス西日本株式会社)を設立
1990年 4月	静岡営業所(現支店)開設
1991年 7月	けいはんな研究所(現基盤技術研究所)開設
1991年 9月	秦野工場開設
1994年 8月	中国に天津島津液圧有限公司を設立
1997年10月	中国に島津(香港)有限公司を設立
1999年 6月	中国に島津国際貿易(上海)有限公司(現島津企業管理(中国)有限公司)を設立
2003年 1月	田中耕一記念質量分析研究所開設
2007年 1月	アラブ首長国連邦にシマヅ ミドル イースト アンド アフリカ エフゼットイー(SHIMADZU MIDDLE EAST AND AFRICA FZE)を設立
2011年 4月	分析計測機器のサービス関連子会社を株式会社島津アクセスとして統合・再編
2019年 2月	韓国にシマヅ サイエンティフィック コリア コーポレーション(SHIMADZU SCIENTIFIC KOREA CORPORATION)を設立